中间体废水COD高。、高氨氮、高盐、高色度的特点。所谓的药物中间体实际上是药物合成过程中使用的一些化学原料或化学产品。该化工产品可在普通化工厂生产，无需药品生产许可证。只要达到一定水平，就可用于药物合成。合成步骤长，中间体复杂，分子结构稳定，使药物中间体的废水成分非常复杂，含有大量有毒、难降解的有机化合物和Cl-、SO42-等待无机盐。这是目前化工污水处理行业的一个重要难点。

常用的处理工艺：

化学氧化 生化方法。由于中间体废水COD高，生物毒性高，常规微生物无法承受中间体废水中的有毒污染物，无法直接进行常规生化处理，可部分去除化学氧化，降低生物毒性后进行生化处理。化学氧化方法包括臭氧氧化、次氯酸钠氧化、臭氧-双氧水联合氧化、Fenton氧化等化学试剂氧化，以及湿氧化、电解氧化、光氧化、高温裂解等氧化方法。该方法的缺点是工艺流程长，投资成本高，运行成本高。